Que conste que en la última versión del aMule 2.2.3 no sé si lo hace por defecto al instalarse ya que no la he probado aún pero en la 2.2.2 a mi no me funcionaba y en la 2.2.0 sí que iba.
Lo primero ir a Mozarella Firefox y en la barra de direcciones teclear “about:config”
Y usando ese botoncito mágico derecho del ratón añadir el valor lógico:
“network.protocol-handler.external.ed2k” con valor “true”
luego ñadir el valor cadena:
“network.protocol-handler.app.ed2k” con la siguiente cadena “/usr/bin/ed2k”
Y tachaan, ya está 
Como comentario bajo linux yo prefiero utilizar el eMule Xtreme 7.1 con wine, que aunque come algo más de recursos el programa es una maravilla, porque para mi el aMule está bastante verde por falta de desarrolladores aunque los que... ... leer más en >>> covarrus.wordpress.com
